果蔬農藥殘留是個令人頭痛的問題，相比生食而言，常規烹飪及預處理能除掉大部分農藥。油炸、焯水、去皮和搓洗是最有效的幾種途徑，其中油炸可去除90%農藥，焯水則接近80%。削皮對某類農藥去除率可達100%，搓洗平均也能達到60%。根據數據，燒烤是最糟糕的加工方式，蔬菜在燒烤后農藥含量不降反升。

有生活專家建議用白醋、小蘇打或食鹽加水來浸泡果蔬，有一定道理，相當一部分農藥在酸性或堿性環境下會加快分解。但這也會導致綠葉菜的細胞通透性提高，使得蔬菜表面上的農藥進入內部，很難去除。更有甚者，敵百蟲在堿性條件下能漸漸轉化為敵敵畏，后者毒性是前者的10倍。因此，在農藥種類求知的情況下，還是采取溫和的清洗方法為妙。